Родился в семье церковного органиста. С 1902 учился в Краковской академии искусств под управлением Флориана Цинка, Яна Станиславского и Леона Яна Вычулковского. В 1904—1905 сделал творческую поездку в Италию.
Возвратившись на родину поступил на работу в мастерскую доктора Юзефа Панкевича.
С 1911 работал в Краковской академии искусств, прошëл путь от младшего помощника до доктора графики (1929).
В 1937 был награжден золотой медалью на Глобальной выставке в Париже. Его пейзажи получили много наград в стране и за рубежами Польши.
Творчество
Ян Войнарский — мастер пейзажа, почаще маленького формата, в каких осязаемо воздействие творчества Яна Станиславского.
Обширно узнаваемый график.
Автопортрет художника находится в коллекции Английского музея, много работ в Краковском Государственном музее и Государственном музее в Варшаве.